Cell子刊：不同RNA修饰间的互作关系

时间：2018-01-08 00:00:00 来源：网络整理

中科院上海生命科学研究院，中科院－马普学会计算生物学伙伴研究所的研究人员发表了题为“N6-Methyladenosines Modulate A-to-I RNA Editing”的文章，揭示了两种最为普遍存在的RNA水平修饰——腺苷N6位置上的甲基化(m6A)和腺苷至次黄苷碱基(A-to-I)编辑之间的互作关系，阐明了m6A修饰对A-to-I编辑的负向调控作用及其机制。该成果将为全面揭示复杂RNA表观修饰调控提供新思路。

这一研究成果公布在Molecular Cell杂志上，由杨力研究组、陈玲玲研究组合作，第一作者为计算生物学所博士后向剑锋、博士研究生杨钦和生化与细胞所博士研究生刘楚霄。

迄今为止，多达100多种的RNA修饰已在体内被发现，其中m6A修饰及A-to-I编辑是存在于(m)RNA上最普遍的两种RNA水平的表观修饰，且都发生于腺苷(adenosine，A)上。这两种A上的RNA表观修饰在催化原理和发生位置上存在着很大的不同：m6A主要由甲基化酶复合体(METTL3和METTL14)催化发生，并由去甲基化酶(FTO和ALKBH5)可逆调节去甲基，其主要发生在单链RNA的A碱基上；而A-to-I编辑主要由ADAR酶介导，其主要发生在位于双链RNA的A碱基上，尚未发现可逆的编辑酶。

基于它们在催化原理和发生位置上的差异，可以推断m6A和A-to-I这两种最为普遍的RNA表观修饰一般情况下不会竞争在同一个A碱基位置发生。但它们之间是否存在其它的互作关系并不清楚。

在最新研究中，研究人员利用计算和实验相结合的系统研究方法，对m6A阳性和m6A阴性的RNA-seq数据进行了A-to-I编辑的比较分析。

研究表明，m6A修饰与A-to-I编辑之间存在着一定的负相关关系，研究人员也通过对m6A甲基化酶METTL3、METTL14敲除样本中A-to-I编辑的分析及比对，进一步揭示了m6A修饰对A-to-I编辑的负向调控作用。

此外，他们通过对多个内源转录本和构建的报告质粒在正常条件和METTL3/METTL14双敲条件下进行比较分析，发现ADAR1与阳性转录本的结合能力较弱，而在METTL3/METTL14双敲抑制m6A时，ADAR1与m6A阴性转录本的结合能力则显著提高，这提示m6A修饰对A-to-I编辑的负向调控作用可能是通过调节其与ADAR1的结合能力而实现的。

原文标题：

N6-Methyladenosines Modulate A-to-I RNA Editing

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