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2018年12月27日,《proceedings of the National Academy of the Sciences of the United States of America,pNAS》杂志在线发表题为“Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated DNA target cleavage”的论文。该论文在原子水平阐明了细菌的Agos蛋白中参与切割活性的两个对称的精氨酸的重要意义。
RNA干扰对基因的表达调控具有重要作用,并且在生物中普遍存在。Ago蛋白结合小RNA是RNA诱导的沉默复合体的核心组分,它们利用小的RNA引导链靶向互补配对的RNA分子,降解目的mRNA或者抑制目的mRNA的翻译。与真核Ago蛋白利用RNA引导链靶向RNA分子不同,大量研究表明原核Ago蛋白利用DNA引导链靶向DNA分子,具有DNA介导的DNA干扰作用。TtAgo 是通过RNase H型机制剪切靶标DNA或者RNA,Ago构象的改变促进活性中心在非活性状态和活性状态之间转换,但是Ago具体催化机制还不清楚。
在这项研究中,王艳丽课题组及其合作者发现在TtAgo中的两个带正电荷的氨基酸具有重要作用。在TtAgo中R545在切割靶链时是稳定指构象的主要的氨基酸残基而R486的作用比较微弱,这就表明在不同种生物的Ago蛋白切割靶链时谷氨酸指两边的氨基酸残基的分子机制有所变化。
这项研究为中国科学院生物物理研究所王艳丽课题组与香港科技大学Xuhui Huang实验室以及纽约大学Yingkai Zhang实验室合作完成。其中,中国科学院生物物理研究所王艳丽研究员、香港科技大学Xuhui Huang教授、纽约大学Yingkai Zhang教授是本文的共同通信作者。该研究得到科技部、国家自然科学基金以及中国科学院战略性先导科技专项(B类)的资助,上海同步辐射光源(SSRF)以及日本同步辐射光源Spring-8为该研究提供了重要的技术支持。
原文标题:
Two symmetric arginine residues play distinct roles in Thermus thermophilus Argonaute DNA guide strand-mediated DNA target cleavage
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