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Nature子刊:新一代测序平台可以准确检测数千个COVID-19患者样本

时间:2021-03-04 00:00:00 来源:网络整理

根据最新发现,多伦多研究人员设计的一个机器人平台,可以一次筛选数千个COVID-19样本,有可能彻底改变实验室追踪病毒和其他病原体传播的方式。

这项研究周三发表在Nature Communications杂志上,由Lunenfeld Tanenbaum研究所(LTRI)的研究人员设计的新一代超高通量测序平台,名为C19-SpAR-Seq,研究证明其阳性检出率高达95%以上。

“快速、准确地识别阳性样本对于抗击这场流行病至关重要,”多伦多大学分子遗传学系教授、LTRI高级研究员Jeff Wrana博士说,“随着新的和潜在的危险变体的流行,这一个可扩展的、自动化的平台能够在单个仪器运行中分析数千个COVID-19患者样本。”

在2020年末,该团队利用机器人平台,通过快速测序病毒基因组的指纹区域来寻找关键突变,从而筛选出数千个阳性样本中的变种。

UHN的微生物学家Mazzulli博士说:“与Wrana博士和他的团队共事是一件非常愉快的事情。他的新型SpAR-Seq系统是尖端技术,他的团队对COVID-19样本进行实时测序的能力对我们了解流行病学和新型突变体的传播具有巨大的潜力。”

这个平台也很划算。研究指出,当同时运行数千个样本时,每个样本的成本仅为8美元左右,因为规模大,因此每个样本的成本降低。

“这是非常可靠的”,运转周转时间约为24小时。这很简单,因为我们几乎已经自动化了流程中的每一步。对我来说,看到这项研究成功是一件非常令人兴奋的事情。”

(生物通)

原文链接;

http://dx.doi.org/10.1038/s41467-021-21653-y

A multiplexed, next generation sequencing platform for high-throughput detection of SARS-CoV-2


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