剑桥大学团队揭示新冠病毒如何在养老院中传播

时间：2021-03-05 00:00:00 来源：网络整理

众所周知，养老院是传染病的高危场所。养老院中通常居住着多名老年人，他们往往还患有心脏病、糖尿病和呼吸系统疾病。这些老年人的生活环境有多个公共空间，而且在封闭空间内与工作人员和探访人员有大量接触。

剑桥大学和Sanger研究所领导的研究团队结合基因组测序和详细的流行病学资料，研究了新冠肺炎COVID-19对养老院的影响，并研究了新冠病毒在这些环境中的传播。这项研究于3月2日发表在《eLife》杂志上。

新冠病毒（SARS-CoV-2）是一种RNA病毒，因此在每次复制时，它的遗传密码很容易出错。目前估计，该病毒每个月变异2.5个核苷酸。对病毒基因组进行测序，可提供有关病毒本身及其传播的宝贵信息。它可以帮助研究人员创建“家谱”（即系统发育树），以显示各个样本之间的关系。

在这项新研究中，研究人员分析了从6,600名患者身上采集的样本，这些样本是在2020年2月26日至5月10日期间采集的。其中，1,167例（18%）是养老院居民，来自英格兰东部的337家养老院。疗养院居民的年龄中值为86岁。

每个养老院的平均病例数为2例，但病例最多的10个养老院占了164例。与非养老院居民相比，因COVID-19住院的养老院居民被送往重症监护室的可能性较小（<7% vs 21%），但死亡的可能性较大（47% vs 20%）。

与此同时，研究人员还探讨了养老院和医院之间的关联。68%的养老院居民在研究期间入院。其中，57%的居民患有COVID-19，6%的病例疑似是医院获得性感染，而33%的病例在检出阳性后7天内出院。这些结果凸显了医院和养老院之间存在大量的病毒传播机会。

研究人员在分析病毒的基因组序列时发现，在一些病例最多的养老院，所有病例都紧密聚集在一棵系统发育树上，要么基因组序列相同，要么仅有一对碱基的差异。这对应了养老院内的某一次疫情暴发。相比之下，其他几个疗养院的病例则散布在整棵系统发育树上，具有更广泛的遗传差异，这表明这些病例中的每一个都是独立的，与共同的传播源无关。

共同通讯作者、剑桥大学医院的名誉顾问Estée Török博士表示：“老年人，特别是养老院中那些身体虚弱的老年人，特别容易患上COVID-19，因此我们必须尽一切努力来保护他们。防止新的感染进入养老院，这应当是限制疾病暴发的重点，同时要采取措施，限制病毒在养老院内部的传播。”

剑桥大学医学院的William Hamilton博士补充说：“这种‘基因组监测’技术可以帮助养老院和医院等机构更好地了解COVID-19的传播网络。这有助于人们采取感染控制措施，确保这些地方对居民、患者、工作人员和探访人员来说是安全的。”

原文检索：

William L Hamilton, Gerry Tonkin-Hill, et al. Genomic epidemiology of COVID-19 in care homes in the East of England. eLife, 2021; 10 DOI: 10.7554/eLife.64618

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