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最近的研究表明,植物微生物群——植物及其直接环境中的微生物——影响植物的健康、生存和健康。微生物组的初始装配尤为重要。组装是指在微生物群中产生物种类型和数量的过程。本研究对几种杨树的微生物群落初始组装进行了表征。研究发现,随着时间的推移,微生物组的组成发生了巨大的变化。对于微生物群中的古菌和细菌,时间的推移使变异量减少。然而,微生物群中真菌的变异是由几个过程形成的。事实证明,杨树的基因构成并不是研究人员预期的那样重要。
植物微生物组的初始组装可能有助于设定微生物组的未来。这可以决定整个工厂未来的健康状况。然而,尽管科学家对禾草和农作物的初始微生物组了解很多,但他们对杨树等长寿树木的初始微生物组了解较少。杨树可能是生物燃料和其他应用的极好候选者。如果科学家们能更好地了解这种植物的微生物群,他们就能更好地利用这些树木。例如,这项新研究的发现可以帮助科学家利用微生物改善流行树木的健康和生长。
总结最近的研究表明,植物微生物组,特别是该微生物组的初始组装,影响植物的健康、生存和适合度。在这项研究中,科学家们描述了在一个普通花园中属于两个杨树物种的10个基因型的杨树微生物群落的初始组装。研究人员对叶和根组织(叶和根内层)、叶表面、根表面和直接环境(根际)中的微生物进行了排序。他们将分子分析与生态组装模型和源跟踪模型配对,以描述杨树在第一个生长季节的微生物群组装。
科学家们发现,随着时间的推移,在所有与植物相关的栖息地和宿主基因型中,微生物群的组成发生了显著变化。对于古菌和细菌,这些变化主要是由强均质选择(占两两比较的29%至62%)。然而,真菌的组装通常具有多重生态组装过程(弱选择性和扩散过程的混合)的特征。有趣的是,基因型虽然是微生物组组成的显著调节因子,但通常解释的变异比植物相关栖息地的样本日期更少。研究人员定义了一组核心属,平均占微生物群的36%。这个核心群落的相对丰度随时间的推移是一致的。此外,通过使用源跟踪模型,他们确定新的微生物类群既来自地上,也来自地下。结合我们的生态组装零模型,他们发现选择和扩散过程都可以解释叶外(即叶表面和根际)和内层微生物群落之间的差异。结果表明,杨树微生物群落的初始组装与时间、基因型和生境有关,并受到选择因子和随机因子的调节。
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