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反义RNA微调II型MazEF毒素-抗毒素系统的基因表达

时间:2022-01-13 00:00:00 来源:网络整理
摘要

尽管反义rna无处不在,但很少有反义rna的功能特征,这类rna被一些人认为是转录噪声。在这里,我们报道了一种反义RNA(asRNA),aMEF(反义RNA)马泽夫),对II型毒素抗毒素(TA)系统起双重调节作用马泽夫。与I型TA系统和许多其他调控性asRNAs不同,aMEF刺激马泽夫而不是抑制和降解。我们的数据表明,双链RNA中间产物和RNase III对aMEF依赖性调节是不必要的马泽夫表达式。asRNA启动子的缺乏被用来支持asRNA是虚假的转录噪声和无功能的假说。我们证明aMEF启动子在大肠杆菌尽管序列保守性差,这表明启动子序列保守性的缺乏不应该与功能性相关。

重要性对许多生物体的下一代RNA测序表明,转录在基因组中广泛存在,称为普遍转录,并且不依附于注释的基因边界。普遍转录的功能是一个谜,已经引起了相当大的争议,它是转录噪音还是生物学相关。反义转录是一类普遍存在的转录,发生在与注释基因相对的DNA链上。相对较少的普遍转录的asRNAs已被功能特征化,其调控作用或缺乏仍然是未知的。研究这些asRNAs的例子并确定它们是否是功能调节器是很重要的。在这项研究中,我们阐明了asRNA(aMEF)的功能,证明普遍存在的转录物可以发挥功能。


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