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摘要
2019年广泛流行的冠状病毒病(COVID-19)是由新型冠状病毒SARS-CoV-2感染引起的。目前,我们对人类组织中哪些细胞感染了SARS-CoV-2,以及病毒RNA在亚细胞水平上的定位,我们的了解还很有限。在这里,我们提出了一个用杂交链式反应扩增的RNA荧光原位杂交(FISH)制备SARS-CoV-2rna的解剖组织平台。我们开发了针对SARS-CoV-2不同区域(包括ORF1a和N)的探针集,以及专门针对SARS-CoV-2亚基因组mrna的探针集。我们在感染患者的细胞培养和组织(肺、淋巴结和胎盘)中验证了这些探针组。利用这项技术,我们观察到ORF1a和N区不同的亚细胞定位模式。在人肺组织中,我们对SARS-CoV-2和细胞类型特异性标记基因进行了多重RNA-FISH-HCR检测。我们在含有肺泡2型(AT2)细胞标记基因的细胞中发现了病毒RNA(SFTpC公司)肺泡巨噬细胞标记基因(马可)但未在含有肺泡1型(AT1)细胞标记基因的细胞中鉴定病毒RNA(阿格尔)此外,我们观察到病毒RNA在AT2细胞和肺泡巨噬细胞中的不同亚细胞定位模式。总之,我们展示了RNA FISH HCR在细胞系和FFpE(福尔马林固定和石蜡包埋)尸检标本中显示SARS-CoV-2的不同RNA种类。我们期望这个平台可以广泛应用于研究SARS-CoV-2组织病理学,也可以扩展到其他应用,包括研究病毒生命周期、病毒诊断和药物筛选。
重要性在这里,我们开发了原位SARS-CoV-2病毒产生RNA的RNA检测方法。我们从患者的肺组织病理学标本中发现了病毒性胎盘淋巴结的RNA。利用高倍显微镜,我们可以看到这些RNA在单个细胞中的亚细胞分布。
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