Nature发布“整个蛋白质世界”:AlphaFold预测几乎所有已知蛋白质的形状
多区域甲基化数据在测试数据中再现了强的pCBrainAge加速关联。
一篇新的研究论文发表在《Aging》杂志。
阿尔茨海默病(AD)的风险随着年龄的增长呈指数增长,并与衰老的多个分子特征有关,其中之一是表观遗传改变。基于5 '胞嘧啶甲基化(DNAm)或表观遗传时钟的表观遗传年龄预测因子曾提示表观遗传年龄加速可能发生在AD脑组织中。
表观遗传时钟是量化生物衰老的很有前途的工具,假设,研究AD患者的大脑衰老将得到大脑特异性表观遗传时钟的发展的帮助。基于大脑年龄甲基化的预测器可以开发出有意义的疾病关联和广泛的多脑区效用。为了验证这一点,使用DNAm捕获来生成一个基于pC的大脑衰老的表观遗传预测器,显示:(1)强烈反映了AD神经病理学和认知衰退,(2)跟踪多个大脑区域的年龄。
该团队生成了一种新的年龄预测器,称为pCBrainAge,它只在皮层样本中进行训练。该预测器采用主成分分析和正则回归相结合的方法,降低了技术噪声,大大提高了测试重测的信度。“为了描述pCBrainAge的用途范围,我们从宗教秩序研究和Rush记忆和老化项目的多个大脑区域生成了DNAm数据。”
pCBrainAge捕捉到衰老的显著异质性:与现有的表观遗传年龄预测因子相比,其加速显示出与临床AD痴呆、病理性AD和ApOE ε4载体状态的相关性更强。它进一步在多个皮层和皮层下区域发挥作用。
“总的来说,pCBrainAge增加的可靠性和特异性使其成为一个特别有前途的工具,用于研究大脑衰老的异质性,以及潜在的AD风险和恢复力的表观遗传学改变。”
Aging the brain: multi-region methylation principal component based clock in the context of Alzheimer’s disease
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