Sci Rep：转录组水平分析子宫内膜容受性

时间：2015-11-19 00:00:00 来源：网络整理

子宫内膜容受性是哺乳动物胚胎成功着床必不可少的。然而，遗传信息的缺乏仍然是理解奶山羊从接受前期子宫内膜（pE）发育成接受期子宫内膜（RE）过程中潜在机制的一个障碍。

在这项研究中，西北农林科技大学动物科技学院曹斌云教授课题组采用转录组测序获取超过4千万高质量的读段，通过de novo组装获得了102,441个unigenes（转录组测序分析由联川生物协助完成）；使用已知数据库对这些unigenes进行注释。总共有3,255个unigenes在pE和RE中差异表达（DEGs）（p值＜0.05）。此外，还鉴定出76,729~77,102个假定的SNps和12,837个SSRs。进一步生物信息学分析DEGs，揭示许多生物学过程和通路可能涉及RE建立，特别是包括GO项：蛋白水解，细胞凋亡，细胞黏附，以及KEGG通路：细胞周期和细胞外基质（ECM）-受体相互作用。研究人员推测，ADCY8，VCAN，SpOCK1，THBS1，和THBS2可能在子宫内膜容受性发育中发挥重要作用。

转录组de novo组装提供了一个好的起点，将作为进一步研究奶山羊子宫内膜容受性以及未来研究山羊和其他相关哺乳动物基因组的宝贵资源。

参考文献
Zhang L, et al. (2015) Characterization of the Transcriptional Complexity of the Receptive and pre-receptive Endometria of Dairy Goats. Sci Rep. 5:14244. doi: 10.1038/srep14244.

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