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发现
来自加州大学洛杉矶分校Jonsson综合癌症中心的科学家们已经确定了一种关键蛋白质,转录因子TAF12,它在起始前复合物的形成中起着关键作用,该复合物由100多个蛋白质组成,这些蛋白质对蛋白质编码基因的转录是必需的。该团队发现,通过消除TAF12,整个起始前复合物被破坏,全基因组的转录大幅下调。
这一发现可能有助于为靶向TAF12的癌症治疗铺平道路,可能会阻止癌细胞的转录,帮助减少癌症肿瘤的生长。TAF12在小鼠模型中对急性髓系白血病的生长起着至关重要的作用。
“确定TAF12为起始前复合物的基石,使我们能够消除细胞中的起始前复合物,这是以前从未做过的,”Jonsson癌症中心生物化学教授和基因调控项目主任资深作者Michael Carey博士说。
背景
在过去的几十年里,在基因组是如何组织和理解转录因子的结构的原理方面有了重大的进展。然而,增强子如何与启动子(人类和小鼠基因组中控制转录的基因元件)沟通以启动基因的确切细节仍未完全弄清楚。
高效转录是一个在蛋白质合成过程中起重要作用的基本生物学过程,它需要形成一个起始前复合物,该复合物包含100多个转录因子,其中包括两种被称为共激活因子的主要复合物。了解这些主要的共激活因子如何在细胞中发挥作用,对于确定基因激活的精确机制至关重要。在这项研究中,加州大学洛杉矶分校的研究人员试图识别辅激活剂中的关键蛋白质,以确定这种基因调控和转录的知识最终能否应用于癌症治疗。
方法
研究人员进行了shRNA敲除筛选,以确定小鼠胚胎干细胞中基因转录的关键蛋白。研究人员使用了一种被称为生长素诱导降解的技术来快速去除已识别的转录因子,以确定对整个基因组中起始前复合物形成的影响。
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原文检索:The pol II preinitiation complex (pIC) influences Mediator binding but not promoter–enhancer looping
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