百岁老人的后代继承了百岁老人独特的基因足迹
葡萄牙的研究人员在对多个国家暴发的猴痘病毒（MApX）基因组进行分析后发现，这些样本都聚集在一起，表明它们有着单一的源头。
根据世界卫生组织的数据，从今年年初到六月中旬，全球已有2,500多例经实验室确认的猴痘病例，其中大部分是在近两个月报告的。80%以上的病例是由欧洲报告的，12%由美洲报告，而这些病例大多与流行地区没有已知的关联。
研究人员近日对2022 MpXV开展系统发育分析，发现此次疫情可能有着单一源头，与2017年尼日利亚的大规模疫情有关。他们在《Nature Medicine》杂志上报道称，病毒样本似乎正在加速进化，这可能受到宿主ApOBEC3的影响，ApOBEC3是一种宿主抗病毒机制。
资深作者、葡萄牙国立卫生研究所的João paulo Gomes表示：“加速进化是一个观察结果，但我们还不知道这是如何发生的。在2022 MpXV中发现如此多的突变，这完全出乎意料。”
Gomes及其同事分析了他们在5月19日发布的首个2022 MpXV基因组，以及其他14个MpXV基因组序列，其中大部分也来自葡萄牙。
系统发育分析将2022年疫情中的所有样本都置于第3进化枝（clade 3），即以前称为“西非”进化枝的部分。所有样本都紧紧地聚集在一起，表明此次暴发有着单一源头。
与此同时，这些样本还形成了一个分支，与2018和2019年英国、以色列和新加坡病例携带的病毒不同。这表明，2022年的疫情可能是由于尼日利亚病毒的持续传播和演化所致。
不过，2022年的猴痘病毒与2018/2019年的病毒平均相差50个SNp，Gomes认为这比预期的要多得多。他说，对于这种类型的病毒，预计每年会出现一两个突变。由于2022年的病毒是2017年尼日利亚病毒的“后裔”，他们预计会出现大约5到10个突变，而不是50个。
“因此，毫无疑问，我们正面临着加速进化的局面，”Gomes谈道。
研究人员指出，这些变化也倾向于遵循某种模式，将更多的腺嘌呤A和胸腺嘧啶T掺入已经富含A/T的病毒基因组中，这表明人类ApOBEC3系统可能参与了这种加速进化。
ApOBEC3是一种宿主抗病毒机制，可以诱导病毒突变，如果酶不能完全限制病毒，则有可能引起超突变。Gomes指出，这种机制已经在HIV和HpV中发现。
“我们还不知道其后果如何，但我们发现，一些突变正在影响与人类免疫系统相互作用的病毒蛋白，因此，免疫逃逸的机制从理论上说还不能完全放弃，”他补充说。
总的来说，研究人员表示，病毒基因组测序可以帮助科学家更好地了解2022猴痘病毒的传播方式，并深入探索控制这种传播的方法。“我们将继续鉴定和监测在传播过程中实时出现的突变，以便更好地了解宿主的适应情况，”Gomes说。
原文检索
Isidro, J. . et al. phylogenomic characterization and signs of microevolution in the 2022 multi-country outbreak of monkeypox virus. Nature Medicine https://doi.org/10.1038/ s41591-022-01907-y (2021).
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