全新的Affymetrix HLA Analysis软件快速从基因分型数据中获得高分辨率的HLA类型

时间：2015-10-20 00:00:00 来源：网络整理

2015年10月6日，来自加利福尼亚州圣克拉拉的消息 – Affymetrix（纳斯达克代码：AFFX）推出Axiom™ HLA Analysis软件，能够对覆盖主要组织相容性复合物（MHC）扩展区域的任何基因分型数据集进行自动化、高分辨率的人类白细胞抗原（HLA）分型。此软件独特的Imputation算法将基因分型和高分辨率的HLA分型整合在单个分析中，让全基因组关联研究（GWAS）也能实现4位数的HLA分型应用。

HLA是与人类疾病最高度相关的基因组区域，属于MHC的一部分。人体利用HLA蛋白来确定自身与非自身的细胞，并识别被感染的细胞。这些信号的识别触发了免疫反应。多年来，许多HLA疾病关联已被报道，这个领域依然是一个重要的研究领域。

“在Axiom HLA Analysis出现之前，研究人员对他们的样品开展单独的HLA分子检测，或使用复杂的分析流程从基因型数据中产生HLA型别，”Affymetrix的产品经理MaryBeth McCrumb解释道。“我们在此软件中融入的算法提供了简单的‘按键式’分析，可以大幅降低研究人员的成本和工作量。”

人类疾病和移植研究人员，包括从事癌症、免疫学、炎症、表型关联研究和药物敏感性研究的人员，将会受益于这种快速而经济的HLA分型。尽管任何群体的基因分型数据集都可以通过此软件来分析，但目前的参考集合是针对高加索人群的；其他种族的集合将在未来几个月内推出。

对于Affymetrix的芯片客户，Axiom HLA Analysis软件可免费获得，无需任何额外费用，即可实现HLA分型。Axiom HLA Analysis软件可处理Affymetrix的多个芯片产品的数据，包括新的Axiom® Transplant Genotyping Array和UK Biobank Axiom® Array，以及Genome-Wide Human SNp Array 6.0。利用这一新软件，其他厂商系统所产生的基因分型数据也能在Affymetrix研究服务实验室中经济地分析。

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