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circRNA是目前一个比较新的研究热点,有研究表明circRNA广泛存在于动物体内,可能参与了各种复杂的调控过程,但目前关于circRNA的研究主要集中在癌症方面,已有报道称circRNA参与调控癌细胞的增殖、凋亡等过程。但关于circRNA在牛成肌细胞的分化过程中的作用还未见报道。
本研究利用测序技术,在受精90天胚胎样本、出生后24个月成年样本的秦川牛肌肉组织中共鉴定得到了12981个候选circRNAs,包括530个intronic circRNAs。研究发现一个亲本基因可能会产生多个circRNA亚型,但只有1或2个表达水平较高。大多数候选circRNA包含2~7个外显子,与back-splicing sites的 基因组距离通常小于50kb。上游 或下游侧 翼内含子 的长度通 常小于105 nt(平均≈11000nt)。
利用qpCR方法验证了17个差异表达的circRNA,并对下调最显著的circLMO7进行分析。结果表明circLMO7能够吸附miR-378a-3p而解除其对靶基因HDAC4的抑制作用,进而调控成肌细胞的增殖与分化。过表达circLMO7后检测了miR-378a-3p靶基因HDAC4的表达水平,发现circLMO7显著增强HDAC4的表达。
图 circLMO7抑制牛原代成肌细胞的分化
参考文献
Wei XF,et al. (2017) Circular RNA profiling reveals an abundant circLMO7 that regulates myoblasts differentiation and survival by sponging miR-378a-3p. Cell Death and Disease . doi:10.1038/cddis.2017.541
本研究中circRNA测序服务由联川生物提供
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关于联川生物
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