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OMG!所有的朋友,你们的全新单细胞转录组分析试剂盒来咯!

时间:2019-12-06 00:00:00 来源:网络整理

Takara Bio新推出的一款高灵敏度的单细胞全长mRNA分析试剂盒- SMART-Seq Single Cell Kit来咯!该试剂盒基于SMART-Seq技术进行优化改良,具有更高的灵敏度和再现性,适用于单细胞和细胞核的RNA-Seq分析。它可以从已知具有低RNA含量的单个细胞(例如,pBMC)直接生成高质量的全长cDNA,远远超过许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2!


图1. SMART-Seq Single Cell Kit 模板转换机制

下面就详细了解一下它的特点吧!

▪简便的工作流程-可以FACS或其他方法分选的单细胞起始
▪灵敏度高、一致性好-非常适用于单细胞(尤其是RNA含量非常低的细胞和细胞核)RNA-Seq的研究,可检测更多基因
▪可靠的全长cDNA制备Kit:优于许多现有的单细胞全长cDNA合成方法,例如SMART-Seq2
▪高度灵活的工作流程-可与自动化设备兼容


图2. 与Smart-seq2法的比较

以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc,18个重复)和Smart-seq2法(Smart-seq2,20个重复)合成cDNA(均进行19个pCR循环扩增),然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析(所有样本都均一化至1.75M paired-end reads)。

panel A cDNA的制备方法不同,结果也不同。相比而言,Smart-seq2结果中比对到线粒体基因组的比率较高,而检测到基因鉴别的reads数相对较少。
panel B SMART-Seq Single Cell Kit能检测到比Smart-seq2更多的基因。


图3. 与SMART-Seq v4的比较

panel A 以淋巴母细胞系GM12878单细胞为样本制备文库,分别采用SMART-Seq Single Cell Kit(SSsc)和SMART-Seq v4(SSv4)合成cDNA(均用19个pCR循环扩增)。所有样本都均一化至1.25M paired-end reads。使用SSsc建库,能获得更高的文库产量。
panel B 从一位健康供体收集到约50个pMBC单细胞,分别采用SSv4 和 SSsc制备cDNA,然后制备RNA-Seq文库并进行测序分析。不论测序深度如何,SMART-Seq Single Cell Kit检测的基因数均是SMART-Seq v4的1.6倍以上。

产品名称

包装量

Code NO.

SMART-Seq Single Cell Kit

12次

634470

48次

634471

96次

634472

欢迎索取SMART-Seq Single Cell Kit的详细资料


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