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160种可用于治疗COVID-19的新药

时间:2021-07-07 00:00:00 来源:网络整理

剑桥大学的科学家已经确定了200种预计对COVID-19有效的获批药物,其中有40种正在进行COVID-19临床试验。

发表在《Science Advances》上的一项研究中,剑桥大学米尔纳疗法研究所和古尔研究所使用组合计算生物学和机器学习创建一个与SARS-CoV-2感染有关的蛋白质的综合图谱-从帮助病毒进入宿主细胞的蛋白质到因感染而产生的蛋白质。通过使用人工智能(AI)方法检查这个网络,他们能够识别与感染有关的关键蛋白质以及药物可能针对的生物途径。

迄今为止,治疗COVID-19的小分子和抗体方法大多是目前正在进行临床试验或已经通过临床试验并获得批准的药物。许多焦点都集中在几个关键的病毒或宿主靶点,或途径上——如炎症——在这些途径上,药物治疗可被用作一种干预。

该团队利用计算机建模对近2,000种获批药物进行了“虚拟筛选”,并确定了可能有效对抗COVID-19的200种获批药物。其中40种药物已经进入临床试验,研究人员认为这支持了他们所采取的方法。

当研究人员对涉及病毒复制的一类药物进行测试时,他们发现其中两种药物——一种抗疟药和一种用于治疗风湿性关节炎的药物——能够抑制病毒,这为他们基于数据的方法提供了初步验证。

米尔纳疗法研究所主任教授Tony Kouzarides说:“通过全面研究在SARS-CoV-2感染中发挥一定作用的数千种蛋白质——无论是主动感染还是作为感染的后果——我们已经能够建立一个揭示这些蛋白质之间关系的网络。

“然后,我们使用最新的机器学习和计算机建模技术,确定了200种可能帮助我们治疗COVID-19的批准药物。其中,160个以前没有被发现与这种感染有关。这将给我们提供更多的武器来对抗病毒。”

利用人工神经网络分析,该团队根据药物在SARS-CoV-2感染中的首要作用对药物进行分类:针对病毒复制的药物和针对免疫反应的药物。然后,他们提取了一些参与病毒复制的细胞,并用来自人类和非人类灵长类动物的细胞系进行测试。

特别值得注意的是两种药物,柳氮磺胺吡啶(用于治疗类风湿性关节炎和克罗恩病等疾病)和氯胍(抗疟药),研究小组发现,这两种药物减少了SARS-CoV-2病毒在细胞中的复制,提高了它们潜在用于预防感染或治疗COVID-19的可能性。

米尔纳治疗研究所的计算研究和人工智能负责人Namshik Han博士补充说:“我们的研究为我们提供了有关COVID-19潜在机制的意外信息,并为我们提供了一些有希望的药物,这些药物可能被重新用于治疗或预防感染。虽然我们采用了数据驱动的方法——基本上允许人工智能算法来查询数据集——我们随后在实验室验证了我们的发现,证实了我们方法的威力。

“我们希望这一潜在药物资源将加速开发抗COVID-19的新药。我们相信我们的方法将有助于快速应对SARS-CoV2的新变种和其他可能导致未来大流行的新病原体。”

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Han, N, Hwang, W, Tzelepis, K, & Schmerer, p, et al. Identification of SARS-CoV-2 induced pathways reveal drug repurposing strategies. Sci Adv; 30 June 2021


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