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罗彻斯特理工学院的科学家们发现了有关冠状病毒及其几种变体附着在人类细胞上的新信息。最近发表在《生物分子结构与动力学》杂志上的一项研究揭示了这些发现。
研究人员使用了托马斯·h·戈斯内尔生命科学学院(Thomas H. Gosnell School of Life Sciences)副教授格雷戈里·巴比特(Gregory Babbitt)开发的代码,来检查冠状病毒如何利用它们的刺突蛋白将自己附着在它们攻击的宿主细胞上。
领导这项研究的patrick Rynkiewicz ' 20(生物信息学和计算生物学),' 21 MS(生物信息学)说:“我们在分子动力学领域使用复杂的计算机模拟来比较-冠状病毒蛋白质与宿主细胞的第一次相互作用。”“这是病毒刺突蛋白(被称为受体结合域)和人类宿主细胞受体(被称为ACE2)之间的相互作用。”
研究人员研究了SARS-CoV-2和alpha、beta和gamma变异,以及在人类和蝙蝠中发现的几种地方性冠状病毒毒株。作者发现,冠状病毒在两个主要位置抓取人类细胞,随着它进化成新的变种,它对人类目标的控制越来越紧。
巴比特说:“这种病毒与人类ACE2受体有两个接触点,一个在上面,一个在下面。”“从分子动力学的角度来看,真正有趣的是,病毒的早期毒株在两个关键接触区域之一有一个不稳定的相互作用。它抓得不好。随着时间的推移,随着变异的出现,它们变得稳定,相互作用变得不那么棘手。当我们回顾流行的人类菌株时,它们已经存在了很长时间,也许对它们来说至少有50年,它们并没有真正的这种相互作用,它们只是进化到在其他主要相互作用区域非常强的结合。”
Functional binding dynamics relevant to the evolution of zoonotic spillovers in endemic and emergent Betacoronavirus strains
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