Illumina支持加拿大全国性的新冠病毒-19基因组测序计划

2021年11月3日,

来自1万名SARS-CoV-2患者的数据将被用于识别生物标志物，这些标志物可以帮助预测严重疾病的潜在风险，并支持开发抗击COVID-19的新疗法

圣地亚哥，2021年11月3日/美通社/——Illumina Inc.(纳斯达克:加拿大新冠病毒基因组网络(CanCOGeN)旗下的HostSeq正在使用其世界级的测序和生物信息学解决方案，以识别能够帮助预测严重疾病的潜在风险的生物标志物，并支持开发抗击COVID-19的新疗法。通过对加拿大各地确诊或受COVID-19影响的多达1万名患者的基因组进行测序，该项目的发现将帮助研究人员和医学界更好地了解人类遗传学在COVID-19易感性中的作用。

Illumina Connected Analytics (ICA)是该公司的标志性生物信息学解决方案，它将使研究人员能够安全和保密地移动CGEn生成的pb级别的数据集，CGEn是国家的测序和信息学平台，从多伦多(疾病儿童医院(SickKids)的应用基因组学中心(TCAG)、蒙特利尔(麦吉尔基因组中心)和温哥华(加拿大迈克尔史密斯基因组科学中心)的最先进的测序仪，到一个公共的“云”，供经该国批准的一些领先的研究机构和医院的研究人员使用。Illumina自2020年初以来与CGEn密切合作，帮助HostSeq提供全面的端到端试剂供应、测序和信息学解决方案。

Illumina首席技术官、研究和产品开发主管Alex Aravanis医学博士说:“我们很自豪地支持和贡献加拿大研究界正在进行的工作，以更好地理解人类遗传学在COVID-19易感性中的作用。”HostSeq社区共享的数据由基于云的信息学提供支持，将有助于为抗击COVID-19提供信息并加快速度。”

Stephen Scherer博士是疾病儿童研究的负责人，也是CGEn和HostSeq的科学领导者，他指出:“全国有数十名研究人员参与了这项工作，因此数据共享至关重要。”谢勒接着说:“如果我们从这场大流行中学到了什么，那就是答案将来自科学数据。”

Illumina测序技术也被另一个国家项目VirusSeq所利用，该项目协调和资助扩大的基因组测序工作，并支持在一个开放的、伦理的框架内共享数据。迄今为止，VirusSeq以最高的数据准确性对26万多个SARS-CoV-2病毒基因组进行了测序。

“VirusSeq使得我们的公共卫生机构的数据跟踪传播趋势,发现新的集群和疫情并确定进化病毒特征,可能会影响公共卫生和政策决定在加拿大,”卡特琳娜Lopez-Correa说,医学博士,博士,首席科学官和执行官CanCOGeN主任加拿大基因组。

HostSeq和VirusSeq都是加拿大COVID-19基因组网络(CanCOGeN)的一部分，这是一个由加拿大基因组牵头的联盟，致力于生成可获取和可用的基因组数据，为公共卫生和政策决策提供信息，并指导治疗和疫苗开发。

ICA提供了一个全面的、私有的、基于云的数据平台，可以让研究人员在一个安全、可扩展和灵活的环境中管理、分析和探索更大容量的多经济数据。它可以减少与组合多个数据集相关的工作负载和可能的人为错误。对于HostSeq, ICA部署在AWS云上，使用蒙特利尔的AWS Canada (Central) Region。

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