H3K27me3的局部而非整体动态与黄萎病菌基因表达差异有关

时间：2022-02-10 00:00:00 来源：网络整理

摘要

不同的生长条件通常会触发丝状真菌的整体转录反应。这种真菌对环境线索的反应涉及表观遗传调控，包括化学组蛋白修饰。有人提出，条件表达的基因，例如那些编码次级代谢物但同时也在致病物种中起作用的基因，通常与一种特定的组蛋白修饰，H3（H3K27me3）的赖氨酸甲基化有关。然而，到目前为止，还没有关于H3K27me3在不同生长条件下的全球分布的分析报告，以评估H3K27me3动力学是否控制差异转录。利用植物病原真菌染色质免疫沉淀测序（ChIp-seq）和RNA测序数据大丽花黄萎病三年内长大体外培养基中，我们现在显示，在这些生长条件中，全球范围内有相当数量的H3K27me3域显示出稳定的轮廓。然而，我们观察到H3K27me3芯片seq信号的局部数量差异，这些信号与介质间差异转录的基因子集有关。比较体外植物感染过程中的表达结果表明在车前-诱导基因可能需要染色质重塑来实现表达。总的来说，我们的结果显示一些基因座显示H3K27me3动态与伴随的转录变异，但许多差异表达的基因与稳定的H3K27me3结构域有关。因此，我们得出结论，虽然H3K27me3是转录抑制所必需的，但似乎转录激活并不需要H3K27me3的全局擦除。我们提出，不经历动态甲基化的H3K27me3结构域可能通过其他机制参与转录，或者可能提供额外的基因组调控功能。

重要性在许多有机体中，包括丝状真菌，表观遗传机制涉及DNA的化学和物理修饰而不改变遗传序列，这些机制与发育或环境线索的转录反应有关。尽管H3和H3在组织中的异源性转录反应（H3或H3）中具有精确的异源性调节功能。基于芯片和RNA测序数据，我们显示了为土传广寄主范围的维管束植物病原真菌大丽花黄萎病虽然有些基因座显示H3K27me3的动态性，可以促成转录变异，但其他基因座却没有表现出这种依赖性。因此，尽管我们认识到H3K27me3是转录抑制所必需的，但我们也得出结论，该标记不是对环境线索的反应的差异转录的条件反应性全球调节因子。

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