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Nature Genetics：迄今为止最全面的斑马鱼遗传图谱

时间：2022-07-26 10:15:40 来源：网络整理

最新发表的研究表明，医学和生命科学研究人员将受益于迄今为止最全面的斑马鱼遗传数据图谱。

该图谱将帮助研究人员更好地研究各种类型的癌症(如皮肤癌)、心脏病和神经退化。它可能会帮助更多的研究人员在他们的研究中取代哺乳动物模型。

由27个实验室组成的全国范围内的dano - code联盟合作，用新产生的数据对公开存取的数据集进行分类。这项研究发现了140000个DNA区域，这些区域与斑马鱼的基因表达调控有关。

斑马鱼是医学和生命科学研究中第二大最常用的动物模型，这项研究抽取了1802个样本，每个样本有数百万个数据点，为转基因育种和发育和疾病的遗传研究提供了最广泛的候选DNA区域。

这篇论文发表在7月4日的《自然-遗传学》杂志上，详细介绍了几个胚胎发育阶段中涉及的DNA元素，以及对斑马鱼和小鼠之间遗传等价性的理解的改进。

领导这项研究的伯明翰大学发育遗传学教授费伦茨·穆勒说:

“对斑马鱼基因信息进行编目是一项重大突破，它可能会在未来几年为医学和生命科学的一些最令人兴奋的发展奠定基础。

“伦敦帝国理工学院的Boris Lenhard教授和卡罗林斯卡学院的Carsten Daub教授在协调全球50多名研究人员方面发挥了重要作用。由此产生的地图集/地图证明了一个自下而上的跨国界合作倡议如何能够为我们的研究界带来利益。由DANIO-CODE联盟创建的目录是开放获取的，以确保研究人员可以在他们的未来研究中利用遗传信息。

“斑马鱼对研究人员来说是一个非常有益的模型。它们是研究各种疾病和失调的理想候选者，因为它们像胚胎一样透明生长，并且具有不同寻常的再生特性。这些特性已经让研究人员洞察了人类的状况。

“现在，有了我们的新目录，我们离完全实现覆盖人类基因组的地图又近了一步。这种活动将使世界各地的研究人员能够跟上新的治疗方法、药物的步伐，并更好地了解人类和动物疾病。”

卡罗林斯卡学院生物科学与营养系和生命科学实验室的副教授兼组长Carsten Daub领导了这次数据整合，他说:

“这项广泛的研究将所有单独的数据集整合到一个框架中，使世界各地的研究人员能够解决单独研究无法解决的问题。”

文章标题Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements

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