山东农科院：测序联合分析miRNA在phyB介导的光信号通路中的作用

时间：2016-03-04 00:00:00 来源：网络整理

光敏色素B（phyB），是水稻光敏色素家族的一员，在调控一系列发育过程和应激反应中发挥重要作用。然而，水稻中phyB介导的光信号通路涉及的机制却鲜有报道。MicroRNAs（miRNAs）在植物生长发育和应激反应中也发挥重要作用。因此，探索水稻中miRNAs在phyB介导光信号通路中的作用就变得很有趣。

山东省农业科学院谢先芝教授领衔的团队，综合采用高通量测序和降解组分析，鉴定了参与phyB介导光信号通路中的miRNAs及其靶基因（小RNA测序和降解组测序分析由联川生物协助完成）。测序从四叶期野生型（WT）水稻和五叶期phyB突变体水稻中共鉴定出720个已知miRNA，704个新miRNA，以及1957个靶基因在野生。其中，135个miRNAs显示差异表达，表明这些miRNAs的表达受phyB直接或间接地控制。此外，鉴定出其中32个差异表达的miRNAs可以剪切70个水稻基因。分析这些靶基因显示，不同转录因子家族的成员所占比例最大，很可能表明miRNA参与phyB介导的光信号通路主要通过调控转录因子的表达。

此项研究结果为表征miRNAs在phyB介导的光信号通路中的功能提供了新线索，这有助于全面揭示植物中光敏色素介导的光形态发生和应激反应的分子机制。

联川公众号正在评选最佳科研故事，马上为科研同行投上支持票！
投票有奖！分享读后感更有机会领健康好礼！活动3月3日截止。

参考文献
Wei Sun, Xiao Hui Xu, Xiu Wu, et al. (2015) Genome-wide identification of microRNAs and their targets in wild type and phyB mutant provides a key link between microRNAs and the phyB-mediated light signaling pathway in rice. Front. plant Sci., 6(372).

联川生物为研究人员提供从miRNA鉴定到调控靶基因功能分析的一站式解决方案

获取更多用户研究案例，请访问www.lc-bio.com或拨打免费咨询热线800-857-1452。

关于联川生物
联川生物成立于2006年，经过多年的快速发展，已成为业界领先的多组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µparaflo®微流体定制化芯片平台，可以为科研用户提供从基因组，转录组，到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一，联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组，可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据分析解决方案。为满足研究人员跨组学高通量研究需求，联川生物已将蛋白质组定量分析引入技术服务线，为用户提供贯穿中心法则的全程解决方案。多年来，联川生物一直与国内的科研团队保持着长期紧密的合作，助力科研人员在生物、医学、和农林领域的科学发现。全球科研用户使用联川生物的优质科研服务和高质量组学实验数据已发表了逾600篇高水平研究论文，其中已在Cell，Nature，Science系列顶级期刊上发表论文22篇。

郑重声明：文章仅代表原作者观点，不代表本站立场；如有侵权、违规，可直接反馈本站，我们将会作修改或删除处理。