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随着新冠疫情的蔓延,美国不少公司的股价都在下跌,不过,pacific Biosciences公司的股价在周三上涨了5%。原来,pacBio的长读长测序技术在新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的研究大显身手。
pacBio表示,商业,学术和政府研究团队的科学家正在使用高度精确的单分子实时(SMRT)测序技术来解析个体或整个患者群体中可能存在的新冠病毒(SARS-CoV-2)变异。这对于开发和优化有效的诊断方法, 疫苗和治疗药物的研发都至关重要。
他们提到,很多与COVID-19相关的研究工作都使用到了pacBio HiFi测序,因为这是目前唯一一种能够兼顾长读长和高准确度的测序技术。这样的数据非常适合诸如病毒测序之类的应用,能够区分整个病毒基因组中仅有的少数单核苷酸变异(SNV)。
例如,pacBio表示,它正在与LabCorp合作,对大量来自疑似阳性样本中的SARS-CoV-2病毒进行测序。LabCorp的科研团队将利用这些信息来发现不同地区病毒的突变情况,从而阐明病毒的进化,及其对疾病严重性和治疗结果的影响,从而有助于支持更好的患者治疗决策。
LabCorp首席科学官Marcia Eisenberg表示:“随着我们努力尽快并尽可能多地了解这种新冠病毒的生物学特性,以帮助应对当前的大流行以及未来的暴发,SMRT测序将为我们提供一份准确且高分辨率的病原体视图。”
pacBio的首席科学官Jonas Korlach表示,两家公司的科学家将在操作方案、工作流程和数据分析等方面密切合作。
与此同时,加州大学圣地亚哥分校的科学家也在利用pacBio SMRT测序来生成靶向的病毒基因组数据,并利用鸟枪法鉴定COVID-19感染后的鼻腔组织微生物组。
加州大学圣地亚哥分校微生物组创新中心主任Rob Knight表示,SMRT测序所产生的高度准确的HiFi序列将帮助研究人员更好地了解SARS-CoV-2病毒,以及它在人体内如何作用。
此外,德国Borstel研究中心的科学家将对SARS-CoV-2以及从常规诊断样品中收集到的其他肺部病原体进行测序,以促进基因组诊断应用并研究这些病原体的传播和进化。范德比尔特疫苗中心则在研究人类B细胞对病毒的反应,以便鉴定出治疗性或保护性抗体。
Korlach表示:“我们为能够支持迅速扩大的抗击COVID-19的客户群体而感到自豪,并相信SMRT测序的独特优势将助力科学家们更深入地研究病毒生物学,并直接支持当下急需的诊断测试、疫苗和抗COVID-19的药物研发。”
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