一种新型、快速、简便的SARS-CoV-2基因分析系统

时间：2021-04-15 00:00:00 来源：网络整理

SARS-CoV-2病毒是导致COVID-19大流行的病毒。我们知道SARS-CoV-2的基因组发生了突变并传播，但这些突变有什么影响?

由于冠状病毒的基因组很大，目前研究SARS-CoV-2基因组突变的方法非常复杂和耗时，但现在大阪大学和北海道大学的一个团队开发了一种基于pCR的快速反向遗传学系统，用于分析SARS-CoV-2突变。

该系统采用聚合酶链反应(pCR)和环状聚合酶延伸反应(CpER)重建病毒基因组的全长cDNA。这个过程不需要使用细菌，因为细菌会导致更多不必要的突变，而且只需要两周的时间，通过简单的步骤产生有传染性的病毒颗粒。以前的方法需要几个月的时间，而且过程非常复杂。

“这种方法使我们能够快速检查SARS-CoV-2突变的生物学特征，”该研究的主要作者Shiho Torii说。“我们可以使用CpER技术制造每个突变的重组病毒，并与亲代病毒比较，检查它们的生物学特征。SARS-CoV-2的大环状基因组可以由更小的DNA片段构建，然后用CpER制成活病毒基因组，用于感染合适的宿主细胞。大量传染性病毒颗粒可在9天后回收。”

通讯作者Yoshiharu Matsuura解释说:“我们相信，我们的CpER方法将有助于理解SARS-CoV-2的传播机制和发病机制，并有助于确定新出现的突变的生物学意义。这可以加快新冠肺炎新型治疗和预防措施的开发。”该研究小组还建议，使用CpER方法将允许研究人员将“报告基因”插入SARS-CoV-2基因组，以“标记”感兴趣的基因或蛋白质。这将有助于进一步了解SARS-CoV-2是如何感染细胞并导致COVID-19的，并有助于开发治疗方法。CpER方法甚至可以产生不能致病的重组病毒，可作为一种安全有效的SARS-CoV-2疫苗。

SARS-CoV-2一直在发生突变，以及这些突变的作用以及它们是否会影响疫苗的有效性等问题。这种方法简单而快速，可以使全球科学家能够确定突变体的特征，这是我们抗击SARS-CoV-2的重要一步。

Establishment of a reverse genetics system for SARS-CoV-2 using circular polymerase extension reaction

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