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纽约州伊萨卡——随着世界进入与大流行相关的不确定性的第三年,有一件事似乎是肯定的:SARS-CoV-2病毒发生了变异,让我们保持警惕。
兽医学院微生物和免疫学学系病毒学教授加里·惠特克(Gary Whittaker)实验室的新研究概述了2020年末出现的omicron的老变种兄弟alpha的关键信息。事实证明,最初产生alpha的突变与产生omicron的突变非常相似,但每种突变的严重程度都有非常不同的结果。
惠特克是《SARS-CoV-2变种B.1.1.7 (Alpha) Spike蛋白水解激活的p681H突变功能评估》的通讯作者,该文章于12月10日发表在《isscience》杂志上。其他贡献者包括艺术与科学学院化学和化学生物学副教授苏珊·丹尼尔;人口医学和诊断科学(CVM)副教授Diego Diel;以及博士后研究员哈维尔·杰米斯博士。
科学家们注意到,在alpha的刺突蛋白的关键区域,称为furin卵裂位点发生了重大突变。这个地方被认为是病毒肆虐的源头。然而,惠特克说:“这实际上是相对无关紧要的。”虽然alpha在furin裂解位点有一个显著的突变,但它对alpha感染细胞和引起疾病的能力几乎没有影响。
然而,alpha和ommicron具有相同的furin裂解突变,在不同的遗传背景下,这可能可以解释为什么ommicron传播得像野火一样快,但似乎引起的疾病不那么严重。“Omicron有很多与alpha相同的功能,”惠特克说。“所以我们对alpha的了解有助于我们理解omicron和未来可能的变体。”
惠特克说,Alpha在美国可能不像在其他地方那么熟悉,因为它在世界舞台上首次亮相的时间。
“在美国,Alpha没有引起人们的注意,因为当时它对我们的影响没有那么大,”他说。“在英国,它就像一把大锤。它是在圣诞节(2020年)之前到来的,基本上取消了这个节日,并成为相当大的政治事件。
“当它到达美国时,”他说,“大约在2月(2021年),因此影响要小得多。”
尽管alpha在美国没有特别影响,但从科学的角度来看,它的出现是重要的。这是SARS-CoV-2病毒的第一个主要突变,发生在furin切割位点。然而,alpha的这种变化并没有对该变体作为一种疾病的影响产生太大的影响。惠特克说,直到delta的出现,它在同一位点发生了不同的突变,才“正确地发挥作用”,把病毒变成了一种更致命的武器。
虽然美国确实感受到了Delta病毒的严重性,但当前的Omicron呈现出一些略微不同的东西。新出现的证据表明,尽管这种最新的变种具有高度传染性,但它的危害要小得多。
“欧米克隆又回到了起点,”惠特克说。“它回到了阿尔法蛋白裂解位点的相同基因变化。作为一种疾病病原体,它在进化轨迹上倒退了一大步。”
这一点在该变体引起细胞间融合的能力方面表现得最为明显——这是用来确定该病毒在宿主体内引起毒性的能力的一个迹象。“Alpha会导致细胞融合,”惠特克说。“Delta将会融合更多的细胞....但后来出现了omicron,它的宿主细胞完全没有融合。它已经完全倒退了。”
如果alpha和omicron的furin裂解位点本质上是相同的,那么为什么alpha是一个比omicron更致命的变体?答案肯定在这些变异基因构成的另一部分,Whittaker希望能解开这个谜团。
与此同时,他说,社会可以发挥作用。
他说:“病毒会自己做自己的事情,但作为一个社会,我们有能力通过明智的公共卫生政策引导它向一个或另一个方向发展。”
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