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威斯塔研究所Italo Tempera博士说:“我们发现了两种对折叠EBV基因组非常重要的细胞蛋白。”“目前已有针对这些蛋白质之一的药物。我们的数据表明,如果我们对EBV感染的细胞使用这种药物,我们就有了一种方法,可以干预折叠。这意味着我们可以干预爱波斯坦病毒基因组的运作方式。”
EBV是一种动态病毒,这意味着它可以改变自己的基因表达,它影响着全世界90%以上的人。如果某些病毒基因被表达出来,病毒就会感染b细胞,导致它们过度繁殖,这对于免疫系统受到抑制的人来说尤其成问题,比如移植病人。
坦帕拉和他的同事想要了解病毒如何操纵其基因表达背后的机制。为此,他们使用了一种改良的DNA测序技术来研究基因组在不同条件下是如何折叠的。
坦佩拉说:“这种病毒很聪明,它利用调节人类基因组构象的同样机制来调节自己的基因表达。”具体来说,研究人员发现EBV使用两种蛋白质,CTFC和pARp1,它们也在人类基因组的表达中发挥作用。
pARp1已经是治疗卵巢癌的奥拉帕尼(olaparib,品牌名Lynparza)的目标。这项新研究表明,这种药物可能也可以用于治疗EBV阳性淋巴瘤。
“通常,pARp1是DNA损伤的目标,”坦帕拉说。“我们的论文显示,还有另一个角色的pARp1染色质折叠,这表明,也许我们可以扩大的方式我们可以使用这种药物不仅干扰DNA损伤,但我们也可能会妨碍DNA折叠和基因表达,这是我们现在正在测试在实验室里。”
合著者:来自Wistar研究所的Sarah M. Morgan, Lisa Beatrice Caruso, Andrew Kossenkov, Sarah Boyle, paul M. Lieberman和Italo Tempera;俄勒冈大学的Hideki Tanizawa;来自菲尔斯癌症研究和分子生物学研究所的Michael Hulse,天普大学Lewis Katz医学院的;科瑞尔医学研究所的Jozef Madzo和Kelsey Keith;Fox Chase癌症中心的谭银飞。
Journal Reference:
Sarah M. Morgan, Hideki Tanizawa, Lisa Beatrice Caruso, Michael Hulse, Andrew Kossenkov, Jozef Madzo, Kelsey Keith, Yinfei Tan, Sarah Boyle, paul M. Lieberman, Italo Tempera. The three-dimensional structure of Epstein-Barr virus genome varies by latency type and is regulated by pARp1 enzymatic activity. Nature Communications, 2022; 13 (1) DOI: 10.1038/s41467-021-27894-1
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